blob: 60b18c9b84a0b21e1137d5fa625368c537ce022f (
plain) (
blame)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
|
--- Makefile.orig Thu Feb 9 12:03:37 2006
+++ Makefile Thu Feb 9 12:07:21 2006
@@ -7,7 +7,7 @@
# in dropnfa.c (wrp 3/19/1998)
#
-CC= gcc -g -O3
+#CC= gcc -g -O3
#CC=gcc -Wall -pedantic -ansi -g -O
#CC = gcc -g -DDEBUG
#CC= /opt/parasoft/bin.linux2/insure -g -pg -DDEBUG
@@ -21,7 +21,7 @@
#CFLAGS= -DSHOWSIM -DUNIX -DTIMES -DHZ=100 -DSFCHAR="'|'" -c -DMAX_WORKERS=2 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DSUPERFAMNUM -DUSE_MMAP -D_REENTRANT -DBIG_LIB64 -D_LARGE_FILE_SOURCE -DUSE_FSEEKO -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -DHAS_INTTYPES -DSAMP_STATS
# standard options
-CFLAGS= -DSHOWSIM -DUNIX -DTIMES -DHZ=100 -DSFCHAR="':'" -c -DMAX_WORKERS=2 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"wrpx00.bioch.virginia.edu/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -D_REENTRANT -DHAS_INTTYPES -D_LARGEFILE_SOURCE -D_LARGEFILE64_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -DUSE_FSEEKO -DSAMP_STATS -DPGM_DOC
+CFLAGS+= -DSHOWSIM -DUNIX -DTIMES -DHZ=100 -DSFCHAR="':'" -c -DMAX_WORKERS=2 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"wrpx00.bioch.virginia.edu/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -D_REENTRANT -DHAS_INTTYPES -D_LARGEFILE_SOURCE -D_LARGEFILE64_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -DUSE_FSEEKO -DSAMP_STATS -DPGM_DOC
# -I/usr/local/include/mysql -DMYSQL_DB
#
#(for mySQL databases) (also requires change to Makefile34.common)
@@ -35,10 +35,10 @@
# for Linux
THR_SUBS = pthr_subs2
-THR_LIBS = -lpthread
+#THR_LIBS = -lpthread
THR_CC =
-XDIR = /seqprg/bin
+XDIR = ${PREFIX}/bin
DROPNFA_O = drop_nfa.o
DROPGSW_O = dropgsw.o
|
